Seri Metroid mengalami masalah ketika pertama kali mempertimbangkan untuk masuk ke 3D. Sementara Samus Aran melakukan debut poligonalnya di konsol Nintendo 64, itu hanya melalui Super Smash Bros. sebagai lawan dari permainan arus utama. Butuh beberapa tahun bagi pemburu hadiah Nintendo untuk dibawa ke dimensi ketiga, sampai akhirnya terjadi di GameCube dengan Metroid Prime yang diakui secara kritis yang dikembangkan oleh Retro Studios, untuk informasi seputar game lebih lengkapnya di Berita Game Terbaru.
Terkenal, alasan mengapa seri ini melewatkan Nintendo 64 adalah karena produser seri Metroid Yoshio Sakamoto khawatir tentang cara mentransisikan game ke 3D. Alasan spesifik menurut wawancara lama dengan games™ (sekarang dikenal sebagai gamesradar+) adalah karena dia sendiri tidak dapat membayangkan bagaimana Samus dapat bergerak saat menggunakan pengontrol N64. Dia juga menyatakan bahwa Nintendo sendiri sedang mendekati perusahaan lain yang mungkin bisa mengembangkan game N64 juga, tetapi tawaran itu juga ditolak. Meskipun ini tidak pernah datang dari Nintendo, seorang penggemar sedang menyusun seperti apa tampilan game N64 Metroid.
Konsep ini dibuat oleh pengguna Twitter Luto Akino, yang merupakan pengembang game indie dari Meksiko. Mereka memposting video konsep Metroid 64 ini, di mana Samus sedang membayangkan ulang 3D area Brinstar Bawah. Ini menunjukkan kamera 3D berputar di sekitar Samus, di mana pemain dapat melihat sekeliling dari sudut mana pun. Tidak seperti seri Metroid Prime , proyek ini adalah platformer aksi 3D, di mana Samus dapat mengunci objek tertentu dengan menekan sebuah tombol, yang membuat pemain tetap fokus pada apa yang mereka bidik.
Beberapa gerakan dan senjata Samus juga diperlihatkan dalam video ini, dengan lompatannya yang selalu seperti gerakan pembuka botol, atau kemampuannya menggunakan mekanik lari cepat/menghindar. Selain meriam lengannya, dia juga memiliki akses ke bentuk bola morfnya, yang dapat meletakkan serangkaian bom seperti dari entri 2D-nya. Banyak penggemar membandingkan proyek penggemar dengan game Mega Man Legends Capcom, karena mekanisme permainan orang ketiga yang mirip, untuk lebih lengkpanya di Teknosional.
Game penggemar ini terlihat sangat menjanjikan, karena beberapa orang merasa game ini menangkap seperti apa tampilan Metroid dalam 3D sebelum Metroid Prime diluncurkan. Namun yang lain waspada terhadap proyek ini yang dibicarakan secara publik, karena game penggemar Metroid telah dipaksa untuk menghentikan pengembangan sebelumnya. Beberapa sudah takut akan permintaan tak terelakkan dari Nintendo untuk menghentikan pengembangan lebih lanjut di Metroid 64.
